在京城春风得意时，新任湖南巡抚，同为凤凰同乡的陈宝箴很快给熊希龄递来了橄榄枝。此时的陈宝箴正在湖南力主新政，开学堂、办报馆、兴实业，正需要得力助手。胸怀暖天下之志的熊希龄没有犹豫，没有拒绝，1897年，他放弃在京城的仕途，回归湖南，在长沙时务学堂任总理，主持校务。

在这期间，熊希龄力邀梁启超任中文总教习，谭嗣同、唐才常襄助，一时间时务学堂成了新派人杰荟萃之地。

这是熊希龄仕途大展的起点，也是考验他人生大运的关键时刻。

1898年因为看重熊希龄在湖南新政中的作为，正在变法的光绪帝电令湖南巡抚陈宝箴，要其传知熊希龄、江标等人，”迅速入京，预备召见“。

然而，就在熊希龄与江标等人相约，准备迅速同行进京，与先一步而去的梁启超、谭嗣同共推戊戌变法时，他却突然病倒了，而且是一病不起，进京之行不得不暂时搁浅。

最终，这场恰到好处的大病救了熊希龄。1898年9月，被触怒的慈禧太后悍然发动戊戌政变，光绪遭囚禁，谭嗣同等”戊戌六君子“血洒菜市口。

虽然躲过了生死劫，但慈禧太后并没有忘记他这个维新同党，朝廷紧跟着就下了道严旨：”熊希龄革职永不叙用，并交地方官严加管束。“

但即便如此，熊希龄亦是万幸的。为此，有人难免质疑，病的这么巧，他究竟是真病还是假病？

但更多的后世之人却认为这是老天对一个胸怀”暖“志之人的福报。

此次被慈禧太后一竿子打倒，并没有彻底断送熊希龄的仕途之路。虽然有永不叙用的严旨在，但处在彻底崩溃前夜的清廷早已失去了往日的控制力和扼杀力，熊希龄因才识出众，不久还是得到了新任湖南巡抚赵尔巽的重用。

关键时期，没有没入尘埃，这同样是一种幸运。