到东汉时期，羽林分为羽林左右骑和羽林郎。羽林左右骑的主官为羽林左右监。另外也多有他官监羽林的例子。如阴嵩为中郎将，监羽林十余年。又有窦固为中郎将，监羽林士。以及，来历为侍中，监羽林右骑。
至于羽林郎，则由羽林中郎将统领。当然，到东汉中后期频繁的政变事件中，也多有他官持节统帅羽林的例子，如黄门令具瑗、中黄门孙程..这些宦官势力因持有符节，故可以在政变中直接调动羽林这些禁兵。
详细情况，可参看前引《秦汉军制演变史稿》第二章，笔者对东汉了解不多，就不再赘述。
综括来说，羽林是一个相对独立的系统，其一般由中朝官员如中郎将监领，有时也会让车骑将军这类带号将军统领。至东汉，羽林分为骑和郎两个系统，其统属另有区分，详见前文。
通过前面的叙述，我们可以厘清三个误解。
1.羽林不等于羽林郎。西汉时羽林不称郎，至东汉时才分为羽林左右骑和羽林郎，其中后者具有郎的身份。
2.羽林不全由孤儿组成，其士卒来源是多样的。
3.羽林不由光禄勋指挥，其是较为独立的系统。
