1652年爆发了规模最大的一次起义，因不堪荷兰人沉重地歧视性税收，和士兵临检人头税时的恶劣行径，以郭怀一为首的大陆移民决心起事驱逐荷兰人，计划在中秋节（即9月17日）宴请东印度公司的高官，在席间将其捕杀，再以送客为名抢夺城堡。

不料叛徒告密，被迫在9月8日提前发动。仓促起事的农民，毕竟不是正规军的对手，被上千台湾地区部落武装支持下的120名荷兰火枪兵击败，起义者被杀4千余人，荷兰人仅伤亡10人。另据记载，台湾地区部落武装给荷兰殖民者上交了2800个人头。

这一战给荷兰人留下了错觉，在例行的“仆从荷兰的部落武装不算人”的前提下，“中国人都是懦夫，娘娘腔，闻到火药味就四散奔逃，一个荷兰士兵能打败二十五个中国人。”

战后荷兰经调查认为起义者是要策应郑成功攻击台湾。恰在此时，郑成功围攻漳州半年多后，被清廷援军击败，损失很大，要从大陆撤离到台湾的风声四起，联系到俘虏的供词，两者似乎真的在彼此呼应。这一事件也给荷兰人留下了严重的阴影，此后隔一段时间岛内就疯传郑军即将攻台的消息。

▲郭怀一起义，可见双方的武器相差巨大，中国人很多人只有石块，棍棒，根本无法抵挡火枪的攻击。

其实，当时间进入1640年代后，随着郑氏集团越发壮大，郑荷合作赚银子的好日子，渐渐一去不复返。此时郑芝龙官升福建总兵，在官方支持下，扫荡海上群雄，统一了海上，垄断了中国的对外贸易和对荷兰人的货物供应，自然不再愿意让荷兰人这个中间商赚掉绝大部分利润，1641年郑芝龙打通了从福建安海直抵日本长崎的贸易航线，凭借着充足的货源，开始逐步挤占日本这个荷兰人在东印度地区最赚钱的市场，被打怕了荷兰人只得忍气吞声。

到郑成功时期，一方面明清易代战争对生产的破坏，严重地影响了对荷兰人的货物供应，另一方面，郑成功在泉州起兵后，一直都未能稳固地控制一块大陆的根据地，却常年养兵近10万，因此对军费和各类物资都极度渴求。除了继续扩大到日本的贸易船队，同时还派船只到菲律宾、越南、柬埔寨、暹罗等地贸易，与荷兰人展开激烈地竞争。由于郑氏掌握了瓷器、丝绸、砂糖的绝对货源，商船数量又有绝对优势，荷兰人根本不是对手，利益受到严重侵害，双方因此爆发了激烈的贸易摩擦。

▲郑氏商船队在东洋和南洋的贸易网络

荷兰人索性禁止中国船只前往上述地区贸易，并派船拦截，只许前往台湾和巴达维亚（今雅加达，荷兰东印度公司的总部）。为此郑成功写信向荷兰人抗议，并威胁如果荷兰人执意要这么做，将下令禁止中国商人与荷兰人贸易。荷兰人则认为郑氏的主要资金和军事物资都依赖对外贸易，不会采取这样两败俱伤的措施，不过荷兰人显然低估了郑成功的决心。

▲荷兰在东印度地区的殖民地、据点和贸易网络，台湾占比25.6%，台湾可谓是至关重要。