巴基斯坦的母亲河是印度河，长约3180千米，平均流量6600立方米/秒，是尼罗河的两倍，是底格里斯河和幼发拉底河之和的三倍。
印度河上源为狮泉河（森格藏布），发源于冈底斯山脉冈仁波齐峰东北方向的切日阿弄拉山口西侧，位于中国西藏阿里地区革吉县境内，源头溪流名为邦果贡。印度河从喜马拉雅山脉朝西北方向流入克什米尔，就称为印度河，调头向南流入印度河平原，在巴基斯坦南部信德省的卡拉奇附近流进阿拉伯海。
有些印度人认为世界第三大洋称为印度洋，那印度洋就应该属于印度。有巴基斯坦人嘲笑说：“印度洋不属于印度，甚至连印度河也不属于印度。”印度有很多大河，比如著名的恒河、布拉马普特拉河，但印度河干流大部分河道却在巴基斯坦境内。
自雅利安人翻越伊朗高原，从兴都库什山脉和苏莱曼山脉之间的开伯尔山口进入这片大平原，一条名为Indus（印度河）的大河横亘眼前，古人便称这大块土地为India（印度）。
